Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc8bQ5DU41 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc8bQ5DU41 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc8bQ5DU41 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8bQ5DU41 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms