Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce1lQ5D525 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce1lQ5D525 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms