Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
GpkowQ56A08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28,45■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28,44■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28,42■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
GpkowQ56A08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,34■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
GpkowQ56A08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,28■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
GpkowQ56A08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28,25■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
GpkowQ56A08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,1 ms