Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prune2Q52KR3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prune2Q52KR3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prune2Q52KR3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms