Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ddx49Q4FZF3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx49Q4FZF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddx49Q4FZF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ddx49Q4FZF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddx49Q4FZF3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddx49Q4FZF3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx49Q4FZF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx49Q4FZF3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx49Q4FZF3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx49Q4FZF3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx49Q4FZF3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ddx49Q4FZF3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddx49Q4FZF3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx49Q4FZF3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms