Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ckap2Q3V1H1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ckap2Q3V1H1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ckap2Q3V1H1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ckap2Q3V1H1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms