Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnah12Q3V0Q1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnah12Q3V0Q1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnah12Q3V0Q1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnah12Q3V0Q1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnah12Q3V0Q1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnah12Q3V0Q1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnah12Q3V0Q1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnah12Q3V0Q1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnah12Q3V0Q1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnah12Q3V0Q1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnah12Q3V0Q1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnah12Q3V0Q1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnah12Q3V0Q1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnah12Q3V0Q1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnah12Q3V0Q1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms