Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvipQ3UZP4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms