Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc160Q3UYG1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc160Q3UYG1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc160Q3UYG1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms