Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C87499Q3UX49 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C87499Q3UX49 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C87499Q3UX49 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C87499Q3UX49 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms