Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf223Q3UV31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf223Q3UV31 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf223Q3UV31 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf223Q3UV31 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf223Q3UV31 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf223Q3UV31 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf223Q3UV31 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf223Q3UV31 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf223Q3UV31 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf223Q3UV31 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf223Q3UV31 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf223Q3UV31 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms