Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUX7

Uncharacterized protein C4orf46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UUX7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3UUX7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3UUX7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UUX7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UUX7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3UUX7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3UUX7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3UUX7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3UUX7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.8 ms