Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nkain3Q3URJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkain3Q3URJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkain3Q3URJ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkain3Q3URJ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms