Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc4Q3UMB9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc4Q3UMB9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc4Q3UMB9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc4Q3UMB9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc4Q3UMB9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc4Q3UMB9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc4Q3UMB9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc4Q3UMB9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc4Q3UMB9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Washc4Q3UMB9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Washc4Q3UMB9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Washc4Q3UMB9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Washc4Q3UMB9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms