Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Treml4Q3LRV9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Treml4Q3LRV9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Treml4Q3LRV9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Treml4Q3LRV9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Treml4Q3LRV9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Treml4Q3LRV9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml4Q3LRV9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Treml4Q3LRV9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml4Q3LRV9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Treml4Q3LRV9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms