Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl9Q32KG4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtl9Q32KG4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl9Q32KG4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtl9Q32KG4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1931.5 ms