Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Chrna5Q2MKA5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Chrna5Q2MKA5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Chrna5Q2MKA5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Chrna5Q2MKA5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Chrna5Q2MKA5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Chrna5Q2MKA5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,7 ms