Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ptchd1Q14B62 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ptchd1Q14B62 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ptchd1Q14B62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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