Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Perm1Q149B8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Perm1Q149B8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Perm1Q149B8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.7 ms