Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc162pQ0VG85 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc162pQ0VG85 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms