Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp2b3Q0VF55 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp2b3Q0VF55 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp2b3Q0VF55 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b3Q0VF55 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b3Q0VF55 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp2b3Q0VF55 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp2b3Q0VF55 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b3Q0VF55 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b3Q0VF55 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp2b3Q0VF55 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp2b3Q0VF55 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp2b3Q0VF55 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms