Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hif3aQ0VBL6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hif3aQ0VBL6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hif3aQ0VBL6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hif3aQ0VBL6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms