Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Thbs3Q05895 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Thbs3Q05895 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Thbs3Q05895 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs3Q05895 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs3Q05895 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs3Q05895 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms