Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nf1Q04690 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nf1Q04690 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nf1Q04690 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms