Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a2Q02788 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col6a2Q02788 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col6a2Q02788 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a2Q02788 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms