Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ly9Q01965 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ly9Q01965 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ly9Q01965 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ly9Q01965 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ly9Q01965 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms