Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EgfrQ01279 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EgfrQ01279 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EgfrQ01279 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EgfrQ01279 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EgfrQ01279 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EgfrQ01279 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.3 ms