Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp2P97299 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp2P97299 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp2P97299 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfrp2P97299 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms