Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arf1P84078 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arf1P84078 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arf1P84078 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arf1P84078 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arf1P84078 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arf1P84078 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arf1P84078 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arf1P84078 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arf1P84078 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf1P84078 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf1P84078 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf1P84078 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf1P84078 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf1P84078 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Arf1P84078 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arf1P84078 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf1P84078 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Arf1P84078 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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