Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otx2P80206 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Otx2P80206 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otx2P80206 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Otx2P80206 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Otx2P80206 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otx2P80206 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otx2P80206 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otx2P80206 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otx2P80206 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otx2P80206 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otx2P80206 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otx2P80206 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Otx2P80206 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Otx2P80206 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otx2P80206 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otx2P80206 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Otx2P80206 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Otx2P80206 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otx2P80206 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Otx2P80206 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otx2P80206 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otx2P80206 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otx2P80206 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Otx2P80206 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Otx2P80206 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otx2P80206 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Otx2P80206 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otx2P80206 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otx2P80206 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otx2P80206 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otx2P80206 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otx2P80206 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx2P80206 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otx2P80206 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otx2P80206 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms