Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SeboxP70368 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SeboxP70368 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeboxP70368 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeboxP70368 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeboxP70368 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SeboxP70368 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeboxP70368 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms