Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Surf6P70279 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Surf6P70279 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Surf6P70279 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Surf6P70279 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Surf6P70279 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Surf6P70279 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Surf6P70279 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Surf6P70279 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Surf6P70279 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Surf6P70279 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf6P70279 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf6P70279 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf6P70279 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Surf6P70279 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Surf6P70279 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf6P70279 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Surf6P70279 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Surf6P70279 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms