Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,67■■■■■ 5,38
Abcc9P70170 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,67■■■■■ 5,38
Abcc9P70170 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC48,65■■■■■ 5,38
Abcc9P70170 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC48,64■■■■■ 5,38
Abcc9P70170 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC48,63■■■■■ 5,38
Abcc9P70170 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,62■■■■■ 5,37
Abcc9P70170 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC48,61■■■■■ 5,37
Abcc9P70170 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC48,6■■■■■ 5,37
Abcc9P70170 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,58■■■■■ 5,37
Abcc9P70170 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,58■■■■■ 5,37
Abcc9P70170 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48,57■■■■■ 5,37
Abcc9P70170 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,57■■■■■ 5,37
Abcc9P70170 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC48,57■■■■■ 5,37
Abcc9P70170 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC48,57■■■■■ 5,37
Abcc9P70170 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,56■■■■■ 5,36
Abcc9P70170 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,56■■■■■ 5,36
Abcc9P70170 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC48,56■■■■■ 5,36
Abcc9P70170 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC48,53■■■■■ 5,36
Abcc9P70170 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC48,53■■■■■ 5,36
Abcc9P70170 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48,51■■■■■ 5,36
Abcc9P70170 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48,5■■■■■ 5,36
Abcc9P70170 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,49■■■■■ 5,35
Abcc9P70170 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,48■■■■■ 5,35
Abcc9P70170 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC48,47■■■■■ 5,35
Abcc9P70170 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,47■■■■■ 5,35
Abcc9P70170 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,45■■■■■ 5,35
Abcc9P70170 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC48,45■■■■■ 5,35
Abcc9P70170 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC48,45■■■■■ 5,35
Abcc9P70170 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC48,45■■■■■ 5,35
Abcc9P70170 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC48,44■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,42■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,42■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,41■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC48,4■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC48,4■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,4■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,39■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC48,38■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC48,38■■■■■ 5,34
Abcc9P70170 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,38■■■■■ 5,33
Abcc9P70170 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,37■■■■■ 5,33
Abcc9P70170 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48,35■■■■■ 5,33
Abcc9P70170 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48,35■■■■■ 5,33
Abcc9P70170 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC48,33■■■■■ 5,33
Abcc9P70170 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC48,31■■■■■ 5,32
Abcc9P70170 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,29■■■■■ 5,32
Abcc9P70170 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,29■■■■■ 5,32
Abcc9P70170 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,28■■■■■ 5,32
Abcc9P70170 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,28■■■■■ 5,32
Abcc9P70170 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC48,27■■■■■ 5,32
Abcc9P70170 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC48,27■■■■■ 5,32
Abcc9P70170 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC48,27■■■■■ 5,32
Abcc9P70170 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,27■■■■■ 5,32
Abcc9P70170 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,25■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC48,25■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC48,23■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,23■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48,22■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC48,22■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,22■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC48,22■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,22■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC48,22■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC48,22■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48,21■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,19■■■■■ 5,31
Abcc9P70170 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,18■■■■■ 5,3
Abcc9P70170 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC48,18■■■■■ 5,3
Abcc9P70170 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,17■■■■■ 5,3
Abcc9P70170 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC48,17■■■■■ 5,3
Abcc9P70170 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,17■■■■■ 5,3
Abcc9P70170 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC48,16■■■■■ 5,3
Abcc9P70170 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC48,15■■■■■ 5,3
Abcc9P70170 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,14■■■■■ 5,3
Abcc9P70170 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC48,13■■■■■ 5,3
Abcc9P70170 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC48,12■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC48,12■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48,12■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC48,11■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC48,11■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC48,1■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,1■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,09■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC48,09■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC48,09■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC48,09■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC48,08■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,07■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,07■■■■■ 5,29
Abcc9P70170 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48,06■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC48,06■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,05■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,04■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,04■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48,03■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC48,03■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC48,03■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC48,03■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,02■■■■■ 5,28
Abcc9P70170 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC48,02■■■■■ 5,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,9 ms