Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl39P62892 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl39P62892 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl39P62892 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms