Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpd1P62315 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpd1P62315 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpd1P62315 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd1P62315 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpd1P62315 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpd1P62315 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpd1P62315 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpd1P62315 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpd1P62315 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpd1P62315 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpd1P62315 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpd1P62315 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpd1P62315 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms