Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp46P62069 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp46P62069 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp46P62069 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp46P62069 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp46P62069 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp46P62069 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp46P62069 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp46P62069 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp46P62069 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp46P62069 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp46P62069 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp46P62069 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp46P62069 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp46P62069 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp46P62069 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp46P62069 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp46P62069 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp46P62069 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms