Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcbp1P60335 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcbp1P60335 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcbp1P60335 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcbp1P60335 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcbp1P60335 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms