Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rin3P59729 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rin3P59729 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rin3P59729 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rin3P59729 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rin3P59729 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rin3P59729 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rin3P59729 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rin3P59729 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rin3P59729 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rin3P59729 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rin3P59729 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rin3P59729 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rin3P59729 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rin3P59729 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rin3P59729 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rin3P59729 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms