Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr3bP59470 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr3bP59470 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3bP59470 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr3bP59470 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr3bP59470 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms