Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Csrnp1P59054 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csrnp1P59054 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Csrnp1P59054 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Csrnp1P59054 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp1P59054 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Csrnp1P59054 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms