Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf3P58269 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dpf3P58269 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dpf3P58269 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dpf3P58269 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms