Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmoP56726 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmoP56726 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SmoP56726 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SmoP56726 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SmoP56726 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SmoP56726 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SmoP56726 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SmoP56726 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SmoP56726 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SmoP56726 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SmoP56726 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SmoP56726 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SmoP56726 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SmoP56726 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmoP56726 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmoP56726 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmoP56726 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmoP56726 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmoP56726 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SmoP56726 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmoP56726 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmoP56726 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmoP56726 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SmoP56726 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmoP56726 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmoP56726 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmoP56726 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmoP56726 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmoP56726 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmoP56726 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmoP56726 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmoP56726 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmoP56726 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmoP56726 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmoP56726 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SmoP56726 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmoP56726 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmoP56726 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmoP56726 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmoP56726 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmoP56726 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmoP56726 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmoP56726 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SmoP56726 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SmoP56726 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SmoP56726 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SmoP56726 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SmoP56726 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SmoP56726 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SmoP56726 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SmoP56726 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SmoP56726 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SmoP56726 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SmoP56726 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SmoP56726 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SmoP56726 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SmoP56726 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SmoP56726 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SmoP56726 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SmoP56726 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SmoP56726 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SmoP56726 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SmoP56726 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SmoP56726 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SmoP56726 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SmoP56726 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SmoP56726 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmoP56726 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmoP56726 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmoP56726 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmoP56726 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmoP56726 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmoP56726 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmoP56726 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmoP56726 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmoP56726 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmoP56726 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmoP56726 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmoP56726 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmoP56726 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SmoP56726 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmoP56726 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmoP56726 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmoP56726 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmoP56726 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmoP56726 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmoP56726 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmoP56726 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SmoP56726 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SmoP56726 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SmoP56726 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SmoP56726 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SmoP56726 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmoP56726 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmoP56726 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmoP56726 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmoP56726 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmoP56726 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmoP56726 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms