Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctbp2P56546 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctbp2P56546 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctbp2P56546 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctbp2P56546 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctbp2P56546 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms