Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcanP55066 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcanP55066 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcanP55066 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcanP55066 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NcanP55066 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NcanP55066 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NcanP55066 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NcanP55066 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NcanP55066 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NcanP55066 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NcanP55066 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NcanP55066 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NcanP55066 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NcanP55066 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NcanP55066 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NcanP55066 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NcanP55066 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NcanP55066 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NcanP55066 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NcanP55066 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NcanP55066 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NcanP55066 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NcanP55066 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NcanP55066 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NcanP55066 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NcanP55066 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NcanP55066 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NcanP55066 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NcanP55066 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NcanP55066 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NcanP55066 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NcanP55066 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NcanP55066 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NcanP55066 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NcanP55066 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcanP55066 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcanP55066 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NcanP55066 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NcanP55066 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NcanP55066 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NcanP55066 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NcanP55066 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NcanP55066 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NcanP55066 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NcanP55066 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcanP55066 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcanP55066 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcanP55066 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NcanP55066 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NcanP55066 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NcanP55066 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NcanP55066 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NcanP55066 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NcanP55066 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NcanP55066 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NcanP55066 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NcanP55066 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NcanP55066 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NcanP55066 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NcanP55066 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NcanP55066 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NcanP55066 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NcanP55066 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NcanP55066 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NcanP55066 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NcanP55066 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NcanP55066 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NcanP55066 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NcanP55066 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NcanP55066 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NcanP55066 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NcanP55066 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NcanP55066 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NcanP55066 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NcanP55066 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NcanP55066 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NcanP55066 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NcanP55066 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NcanP55066 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NcanP55066 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NcanP55066 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NcanP55066 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NcanP55066 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NcanP55066 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NcanP55066 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NcanP55066 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NcanP55066 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NcanP55066 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NcanP55066 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NcanP55066 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NcanP55066 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NcanP55066 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NcanP55066 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NcanP55066 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NcanP55066 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NcanP55066 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NcanP55066 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NcanP55066 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NcanP55066 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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