Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad23aP54726 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23aP54726 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23aP54726 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms