Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CebpaP53566 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CebpaP53566 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CebpaP53566 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CebpaP53566 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CebpaP53566 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CebpaP53566 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CebpaP53566 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CebpaP53566 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CebpaP53566 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CebpaP53566 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CebpaP53566 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CebpaP53566 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CebpaP53566 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CebpaP53566 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CebpaP53566 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CebpaP53566 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CebpaP53566 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CebpaP53566 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CebpaP53566 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CebpaP53566 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CebpaP53566 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CebpaP53566 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms