Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DbtP53395 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DbtP53395 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DbtP53395 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DbtP53395 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DbtP53395 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DbtP53395 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DbtP53395 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DbtP53395 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DbtP53395 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DbtP53395 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DbtP53395 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DbtP53395 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DbtP53395 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DbtP53395 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DbtP53395 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DbtP53395 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DbtP53395 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DbtP53395 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DbtP53395 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DbtP53395 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DbtP53395 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DbtP53395 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DbtP53395 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DbtP53395 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DbtP53395 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DbtP53395 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DbtP53395 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DbtP53395 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DbtP53395 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DbtP53395 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DbtP53395 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DbtP53395 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DbtP53395 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DbtP53395 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DbtP53395 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DbtP53395 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DbtP53395 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DbtP53395 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DbtP53395 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DbtP53395 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DbtP53395 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DbtP53395 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DbtP53395 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DbtP53395 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DbtP53395 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DbtP53395 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DbtP53395 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DbtP53395 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DbtP53395 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DbtP53395 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DbtP53395 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DbtP53395 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DbtP53395 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DbtP53395 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DbtP53395 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DbtP53395 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DbtP53395 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DbtP53395 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DbtP53395 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DbtP53395 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DbtP53395 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DbtP53395 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DbtP53395 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DbtP53395 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DbtP53395 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DbtP53395 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DbtP53395 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DbtP53395 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DbtP53395 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DbtP53395 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DbtP53395 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DbtP53395 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DbtP53395 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DbtP53395 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DbtP53395 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DbtP53395 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DbtP53395 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DbtP53395 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DbtP53395 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DbtP53395 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DbtP53395 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DbtP53395 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DbtP53395 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DbtP53395 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DbtP53395 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DbtP53395 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DbtP53395 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DbtP53395 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DbtP53395 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DbtP53395 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DbtP53395 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DbtP53395 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DbtP53395 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DbtP53395 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DbtP53395 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DbtP53395 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DbtP53395 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DbtP53395 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DbtP53395 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms