Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epb41l4aP52963 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Epb41l4aP52963 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Epb41l4aP52963 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Epb41l4aP52963 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Epb41l4aP52963 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms