Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e1P52482 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e1P52482 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e1P52482 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e1P52482 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms