Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BckdhaP50136 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BckdhaP50136 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BckdhaP50136 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BckdhaP50136 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BckdhaP50136 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms